A APAE Fortaleza oferece serviços nas áreas de educação, saúde e assistência social, além de atividades complementares e esportivas.

Serviços educacionais:
O Atendimento Educacional Especializado (AEE) é realizado mediante comparecimento à instituição, com apresentação dos documentos pessoais do responsável e da criança, além da declaração escolar referente ao ano letivo vigente. As matrículas para o ano de 2026 já estão encerradas.

Serviços de saúde:
São oferecidos atendimentos terapêuticos e médicos. Para acesso, é necessário encaminhamento e agendamento prévio por meio da Secretaria de Saúde de Fortaleza. Algumas especialidades médicas também são disponibilizadas de forma particular.

Atividades complementares e esportivas:
A instituição oferece diversas modalidades esportivas. As vagas são destinadas, prioritariamente, aos usuários já atendidos pela APAE Fortaleza.